El Pambilar protege y conserva una pequeña extensión del bosque húmedo tropical de la región conocida como Chocó, que se extiende desde Panamá, continúa a lo largo de la costa pacífica colombiana y se adentra en el noroccidente del Ecuador. Los bosques que existen en esta región, como los de El Pambilar, se caracterizan por dos aspectos en particular: su alta humedad y su gran diversidad de especies.